石磨面粉機加工的質量和在清理過程中清除的雜質的數量，取決于系統的長度和使用的好壞。在某些情況下，一個獨立的多功能設備能清除石子和小麥中存在的大多數雜質，滿足一臺小型石磨面粉機械產量的需要，這樣可以縮短清理系統，更加有效提高能量利用率，并且降低安裝和維修的費用。

    小麥清理設備的基本原理是利用雜質不同的物理性能進行分離，去除雜質。分離的基本依據是磁性、在空氣中的懸浮速度、密度、顆粒大小、形狀、內部的強度和顏色等。色選機、滾筒或碟片分離器和多通道風機這樣的清理裝置，尚有很多優越的性能，需要在實際中發揮。在小麥清理系統中，所有設備的工作性能取決于小麥流經系統時的連貫性，在清理程序中，所有計量裝置是首先要確定的，它能夠完善整個系統的性能，在最大可能地獲取最大化利益的前提下，清理系統的設計應該反映磨粉的生產目標和所期望的面粉質量。清潔的小麥能生產高質量的面粉，提高出粉率，并且降低磨粉機中的磨輥齒的維修費用。

    小麥清理系統的工藝長度與復雜程度可以根據小麥類型和計劃生產的面粉質量來進行調整，不必要或者過度地清理會增加不必要的生產費用。如果生產高精粉，短的清理流程和小的清理空間，僅能清除可能損害設備的雜質，還有更多的雜質和大部分污染的小麥沒有清除;如果生產硬質粗粒面粉或者高質量的面粉，而又對色澤和灰分有嚴格要求的話，清理系統就必須清除直接影響面粉質量的雜質，但是有可能導致臟麥、雜質排出量的降低。