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（1）集約農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)，特別是單一經(jīng)營的高度專業(yè)化系統(tǒng)，缺乏時間和空間上的連續(xù)性。種植農(nóng)作物的農(nóng)場和經(jīng)營單一畜禽的牧場相互分離，不像傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)那樣植物、動物相互利用廢棄物質(zhì)和能量，因而物能不能充分利用。

　　從系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)來看，現(xiàn)代農(nóng)業(yè)往往犧牲食物鏈作用所形成的草牧食物鏈。以大量的肥料能量的投入，縮短草牧食物鏈，以大量的物質(zhì)離開農(nóng)業(yè)系統(tǒng)而輸出，造成了系統(tǒng)有機質(zhì)和養(yǎng)分的虧損。

　　（3）靠大量地投入機械、化肥、農(nóng)藥和飼料添加劑來維持農(nóng)業(yè)系統(tǒng)的高產(chǎn)量和高產(chǎn)出，破壞了自耕農(nóng)在某種程度上保存的一種農(nóng)業(yè)系統(tǒng)內(nèi)部的“控制機制”。

　　（4）種間多樣性和種內(nèi)異質(zhì)性減低，系統(tǒng)的適應(yīng)能力下降，使農(nóng)業(yè)系統(tǒng)過分依賴于能源和人工控制，失去了自然力的“恩賜”。

　　總之,現(xiàn)代農(nóng)業(yè)造成了人與自然的過分分離，其根本的問題在于它忽視了農(nóng)業(yè)的特點。農(nóng)業(yè)的特點在于：具有一定生態(tài)系統(tǒng)的自然條件為其必要的場所，生產(chǎn)對象是生物有機體。農(nóng)業(yè)生產(chǎn)過程是對土地、生物、水、氣候等自然資源和自然條件的改造與利用的過程。農(nóng)業(yè)自然資源很大部分是可更新資源，可以不斷補充，不斷消耗，又不斷恢復，形成良好的有機循環(huán)，持續(xù)地為人類提供愈來愈多的產(chǎn)品。只要農(nóng)業(yè)的上述特點還未消失，就應(yīng)該尊重它的生產(chǎn)流程的獨特性。可見，現(xiàn)代農(nóng)業(yè)并不是農(nóng)業(yè)發(fā)展的最終形式和最好方式。